Bio::Chado::Schema |
A standard DBIx::Class layer for the Chado database schema. |
0.09000 |
metacpan |
Bio::Chado::Schema::Result::CellLine::CellLine |
|
0.09000 |
metacpan |
Bio::Chado::Schema::Result::CellLine::CellLineCvterm |
|
0.09000 |
metacpan |
Bio::Chado::Schema::Result::CellLine::CellLineCvtermprop |
|
0.09000 |
metacpan |
Bio::Chado::Schema::Result::CellLine::CellLineDbxref |
|
0.09000 |
metacpan |
Bio::Chado::Schema::Result::CellLine::CellLineFeature |
|
0.09000 |
metacpan |
Bio::Chado::Schema::Result::CellLine::CellLineLibrary |
|
0.09000 |
metacpan |
Bio::Chado::Schema::Result::CellLine::CellLinePub |
|
0.09000 |
metacpan |
Bio::Chado::Schema::Result::CellLine::CellLineRelationship |
|
0.09000 |
metacpan |
Bio::Chado::Schema::Result::CellLine::CellLineSynonym |
|
0.09000 |
metacpan |
Bio::Chado::Schema::Result::CellLine::CellLineprop |
|
0.09000 |
metacpan |
Bio::Chado::Schema::Result::CellLine::CellLinepropPub |
|
0.09000 |
metacpan |
Bio::Chado::Schema::Result::Companalysis::Analysis |
|
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metacpan |
Bio::Chado::Schema::Result::Companalysis::Analysisfeature |
|
0.09000 |
metacpan |
Bio::Chado::Schema::Result::Companalysis::Analysisfeatureprop |
|
0.09000 |
metacpan |
Bio::Chado::Schema::Result::Companalysis::Analysisprop |
|
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metacpan |
Bio::Chado::Schema::Result::Composite::AllFeatureNames |
|
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metacpan |
Bio::Chado::Schema::Result::Composite::Dfeatureloc |
|
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metacpan |
Bio::Chado::Schema::Result::Composite::FLoc |
|
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metacpan |
Bio::Chado::Schema::Result::Composite::FType |
|
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metacpan |
Bio::Chado::Schema::Result::Composite::FeatureContains |
|
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metacpan |
Bio::Chado::Schema::Result::Composite::FeatureDifference |
|
0.09000 |
metacpan |
Bio::Chado::Schema::Result::Composite::FeatureDisjoint |
featurelocs do not meet. symmetric |
0.09000 |
metacpan |
Bio::Chado::Schema::Result::Composite::FeatureDistance |
|
0.09000 |
metacpan |
Bio::Chado::Schema::Result::Composite::FeatureIntersection |
|
0.09000 |
metacpan |
Bio::Chado::Schema::Result::Composite::FeatureMeets |
|
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metacpan |
Bio::Chado::Schema::Result::Composite::FeatureMeetsOnSameStrand |
|
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metacpan |
Bio::Chado::Schema::Result::Composite::FeatureUnion |
|
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metacpan |
Bio::Chado::Schema::Result::Composite::FeaturesetMeets |
|
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metacpan |
Bio::Chado::Schema::Result::Composite::FnrType |
|
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metacpan |
Bio::Chado::Schema::Result::Composite::FpKey |
|
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metacpan |
Bio::Chado::Schema::Result::Composite::Gff3atts |
|
0.09000 |
metacpan |
Bio::Chado::Schema::Result::Composite::Gff3view |
|
0.09000 |
metacpan |
Bio::Chado::Schema::Result::Composite::Gffatts |
|
0.09000 |
metacpan |
Bio::Chado::Schema::Result::Contact::Contact |
Model persons, institutes, groups, organizations, etc. |
0.09000 |
metacpan |
Bio::Chado::Schema::Result::Contact::ContactRelationship |
Model relationships between contacts |
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metacpan |
Bio::Chado::Schema::Result::Cv::Chadoprop |
|
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metacpan |
Bio::Chado::Schema::Result::Cv::CommonAncestorCvterm |
|
0.09000 |
metacpan |
Bio::Chado::Schema::Result::Cv::CommonDescendantCvterm |
|
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metacpan |
Bio::Chado::Schema::Result::Cv::Cv |
|
0.09000 |
metacpan |
Bio::Chado::Schema::Result::Cv::CvCvtermCount |
per-cv terms counts (excludes obsoletes) |
0.09000 |
metacpan |
Bio::Chado::Schema::Result::Cv::CvCvtermCountWithObs |
per-cv terms counts (includes obsoletes) |
0.09000 |
metacpan |
Bio::Chado::Schema::Result::Cv::CvLeaf |
|
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metacpan |
Bio::Chado::Schema::Result::Cv::CvLinkCount |
|
0.09000 |
metacpan |
Bio::Chado::Schema::Result::Cv::CvPathCount |
|
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metacpan |
Bio::Chado::Schema::Result::Cv::CvRoot |
|
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metacpan |
Bio::Chado::Schema::Result::Cv::Cvprop |
|
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metacpan |
Bio::Chado::Schema::Result::Cv::Cvterm |
|
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metacpan |
Bio::Chado::Schema::Result::Cv::CvtermDbxref |
|
0.09000 |
metacpan |
Bio::Chado::Schema::Result::Cv::CvtermRelationship |
|
0.09000 |
metacpan |
Bio::Chado::Schema::Result::Cv::Cvtermpath |
|
0.09000 |
metacpan |
Bio::Chado::Schema::Result::Cv::Cvtermprop |
|
0.09000 |
metacpan |
Bio::Chado::Schema::Result::Cv::Cvtermsynonym |
|
0.09000 |
metacpan |
Bio::Chado::Schema::Result::Cv::Dbxrefprop |
|
0.09000 |
metacpan |
Bio::Chado::Schema::Result::Cv::StatsPathsToRoot |
|
0.09000 |
metacpan |
Bio::Chado::Schema::Result::Expression::Eimage |
|
0.09000 |
metacpan |
Bio::Chado::Schema::Result::Expression::Expression |
The expression table is essentially a bridge table. |
0.09000 |
metacpan |
Bio::Chado::Schema::Result::Expression::ExpressionCvterm |
|
0.09000 |
metacpan |
Bio::Chado::Schema::Result::Expression::ExpressionCvtermprop |
|
0.09000 |
metacpan |
Bio::Chado::Schema::Result::Expression::ExpressionImage |
|
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metacpan |
Bio::Chado::Schema::Result::Expression::ExpressionPub |
|
0.09000 |
metacpan |
Bio::Chado::Schema::Result::Expression::Expressionprop |
|
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metacpan |
Bio::Chado::Schema::Result::Expression::FeatureExpression |
|
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metacpan |
Bio::Chado::Schema::Result::Expression::FeatureExpressionprop |
|
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metacpan |
Bio::Chado::Schema::Result::General::Db |
|
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metacpan |
Bio::Chado::Schema::Result::General::DbDbxrefCount |
per-db dbxref counts |
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metacpan |
Bio::Chado::Schema::Result::General::Dbxref |
|
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metacpan |
Bio::Chado::Schema::Result::General::Tableinfo |
|
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metacpan |
Bio::Chado::Schema::Result::Genetic::Environment |
The environmental component of a phenotype description. |
0.09000 |
metacpan |
Bio::Chado::Schema::Result::Genetic::EnvironmentCvterm |
|
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metacpan |
Bio::Chado::Schema::Result::Genetic::FeatureGenotype |
|
0.09000 |
metacpan |
Bio::Chado::Schema::Result::Genetic::Genotype |
|
0.09000 |
metacpan |
Bio::Chado::Schema::Result::Genetic::Genotypeprop |
|
0.09000 |
metacpan |
Bio::Chado::Schema::Result::Genetic::Phendesc |
|
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metacpan |
Bio::Chado::Schema::Result::Genetic::PhenotypeComparison |
|
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metacpan |
Bio::Chado::Schema::Result::Genetic::PhenotypeComparisonCvterm |
|
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metacpan |
Bio::Chado::Schema::Result::Genetic::Phenstatement |
|
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metacpan |
Bio::Chado::Schema::Result::Library::Library |
|
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metacpan |
Bio::Chado::Schema::Result::Library::LibraryCvterm |
|
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metacpan |
Bio::Chado::Schema::Result::Library::LibraryDbxref |
|
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metacpan |
Bio::Chado::Schema::Result::Library::LibraryFeature |
|
0.09000 |
metacpan |
Bio::Chado::Schema::Result::Library::LibraryPub |
|
0.09000 |
metacpan |
Bio::Chado::Schema::Result::Library::LibrarySynonym |
|
0.09000 |
metacpan |
Bio::Chado::Schema::Result::Library::Libraryprop |
|
0.09000 |
metacpan |
Bio::Chado::Schema::Result::Library::LibrarypropPub |
|
0.09000 |
metacpan |
Bio::Chado::Schema::Result::Mage::Acquisition |
|
0.09000 |
metacpan |
Bio::Chado::Schema::Result::Mage::AcquisitionRelationship |
|
0.09000 |
metacpan |
Bio::Chado::Schema::Result::Mage::Acquisitionprop |
Parameters associated with image acquisition. |
0.09000 |
metacpan |
Bio::Chado::Schema::Result::Mage::Arraydesign |
|
0.09000 |
metacpan |
Bio::Chado::Schema::Result::Mage::Arraydesignprop |
|
0.09000 |
metacpan |
Bio::Chado::Schema::Result::Mage::Assay |
|
0.09000 |
metacpan |
Bio::Chado::Schema::Result::Mage::AssayBiomaterial |
|
0.09000 |
metacpan |
Bio::Chado::Schema::Result::Mage::AssayProject |
Link assays to projects. |
0.09000 |
metacpan |
Bio::Chado::Schema::Result::Mage::Assayprop |
Extra assay properties that are not accounted for in assay. |
0.09000 |
metacpan |
Bio::Chado::Schema::Result::Mage::Biomaterial |
|
0.09000 |
metacpan |
Bio::Chado::Schema::Result::Mage::BiomaterialDbxref |
|
0.09000 |
metacpan |
Bio::Chado::Schema::Result::Mage::BiomaterialRelationship |
|
0.09000 |
metacpan |
Bio::Chado::Schema::Result::Mage::BiomaterialTreatment |
|
0.09000 |
metacpan |
Bio::Chado::Schema::Result::Mage::Biomaterialprop |
|
0.09000 |
metacpan |
Bio::Chado::Schema::Result::Mage::Channel |
|
0.09000 |
metacpan |
Bio::Chado::Schema::Result::Mage::Control |
|
0.09000 |
metacpan |
Bio::Chado::Schema::Result::Mage::Element |
|
0.09000 |
metacpan |
Bio::Chado::Schema::Result::Mage::ElementRelationship |
|
0.09000 |
metacpan |
Bio::Chado::Schema::Result::Mage::Elementresult |
|
0.09000 |
metacpan |
Bio::Chado::Schema::Result::Mage::ElementresultRelationship |
|
0.09000 |
metacpan |
Bio::Chado::Schema::Result::Mage::Magedocumentation |
|
0.09000 |
metacpan |
Bio::Chado::Schema::Result::Mage::Mageml |
|
0.09000 |
metacpan |
Bio::Chado::Schema::Result::Mage::Protocol |
Procedural notes on how data was prepared and processed. |
0.09000 |
metacpan |
Bio::Chado::Schema::Result::Mage::Protocolparam |
|
0.09000 |
metacpan |
Bio::Chado::Schema::Result::Mage::Quantification |
|
0.09000 |
metacpan |
Bio::Chado::Schema::Result::Mage::QuantificationRelationship |
|
0.09000 |
metacpan |
Bio::Chado::Schema::Result::Mage::Quantificationprop |
|
0.09000 |
metacpan |
Bio::Chado::Schema::Result::Mage::Study |
|
0.09000 |
metacpan |
Bio::Chado::Schema::Result::Mage::StudyAssay |
|
0.09000 |
metacpan |
Bio::Chado::Schema::Result::Mage::Studydesign |
|
0.09000 |
metacpan |
Bio::Chado::Schema::Result::Mage::Studydesignprop |
|
0.09000 |
metacpan |
Bio::Chado::Schema::Result::Mage::Studyfactor |
|
0.09000 |
metacpan |
Bio::Chado::Schema::Result::Mage::Studyfactorvalue |
|
0.09000 |
metacpan |
Bio::Chado::Schema::Result::Mage::Studyprop |
|
0.09000 |
metacpan |
Bio::Chado::Schema::Result::Mage::StudypropFeature |
|
0.09000 |
metacpan |
Bio::Chado::Schema::Result::Mage::Treatment |
|
0.09000 |
metacpan |
Bio::Chado::Schema::Result::Map::Featuremap |
|
0.09000 |
metacpan |
Bio::Chado::Schema::Result::Map::FeaturemapPub |
|
0.09000 |
metacpan |
Bio::Chado::Schema::Result::Map::Featurepos |
|
0.09000 |
metacpan |
Bio::Chado::Schema::Result::Map::Featurerange |
|
0.09000 |
metacpan |
Bio::Chado::Schema::Result::NaturalDiversity::NdExperiment |
|
0.09000 |
metacpan |
Bio::Chado::Schema::Result::NaturalDiversity::NdExperimentContact |
|
0.09000 |
metacpan |
Bio::Chado::Schema::Result::NaturalDiversity::NdExperimentDbxref |
Cross-reference experiment to accessions, images, etc |
0.09000 |
metacpan |
Bio::Chado::Schema::Result::NaturalDiversity::NdExperimentGenotype |
|
0.09000 |
metacpan |
Bio::Chado::Schema::Result::NaturalDiversity::NdExperimentPhenotype |
|
0.09000 |
metacpan |
Bio::Chado::Schema::Result::NaturalDiversity::NdExperimentProject |
|
0.09000 |
metacpan |
Bio::Chado::Schema::Result::NaturalDiversity::NdExperimentProtocol |
Linking table: experiments to the protocols they involve. |
0.09000 |
metacpan |
Bio::Chado::Schema::Result::NaturalDiversity::NdExperimentPub |
Linking nd_experiment(s) to publication(s) |
0.09000 |
metacpan |
Bio::Chado::Schema::Result::NaturalDiversity::NdExperimentStock |
|
0.09000 |
metacpan |
Bio::Chado::Schema::Result::NaturalDiversity::NdExperimentStockDbxref |
Cross-reference experiment_stock to accessions, images, etc |
0.09000 |
metacpan |
Bio::Chado::Schema::Result::NaturalDiversity::NdExperimentStockprop |
|
0.09000 |
metacpan |
Bio::Chado::Schema::Result::NaturalDiversity::NdExperimentprop |
|
0.09000 |
metacpan |
Bio::Chado::Schema::Result::NaturalDiversity::NdGeolocation |
|
0.09000 |
metacpan |
Bio::Chado::Schema::Result::NaturalDiversity::NdGeolocationprop |
|
0.09000 |
metacpan |
Bio::Chado::Schema::Result::NaturalDiversity::NdProtocol |
|
0.09000 |
metacpan |
Bio::Chado::Schema::Result::NaturalDiversity::NdProtocolReagent |
|
0.09000 |
metacpan |
Bio::Chado::Schema::Result::NaturalDiversity::NdProtocolprop |
Property/value associations for protocol. |
0.09000 |
metacpan |
Bio::Chado::Schema::Result::NaturalDiversity::NdReagent |
|
0.09000 |
metacpan |
Bio::Chado::Schema::Result::NaturalDiversity::NdReagentRelationship |
|
0.09000 |
metacpan |
Bio::Chado::Schema::Result::NaturalDiversity::NdReagentprop |
|
0.09000 |
metacpan |
Bio::Chado::Schema::Result::Organism::Organism |
|
0.09000 |
metacpan |
Bio::Chado::Schema::Result::Organism::OrganismDbxref |
|
0.09000 |
metacpan |
Bio::Chado::Schema::Result::Organism::Organismprop |
Tag-value properties - follows standard chado model. |
0.09000 |
metacpan |
Bio::Chado::Schema::Result::Phenotype::FeaturePhenotype |
|
0.09000 |
metacpan |
Bio::Chado::Schema::Result::Phenotype::Phenotype |
|
0.09000 |
metacpan |
Bio::Chado::Schema::Result::Phenotype::PhenotypeCvterm |
|
0.09000 |
metacpan |
Bio::Chado::Schema::Result::Phylogeny::Phylonode |
|
0.09000 |
metacpan |
Bio::Chado::Schema::Result::Phylogeny::PhylonodeDbxref |
|
0.09000 |
metacpan |
Bio::Chado::Schema::Result::Phylogeny::PhylonodeOrganism |
|
0.09000 |
metacpan |
Bio::Chado::Schema::Result::Phylogeny::PhylonodePub |
|
0.09000 |
metacpan |
Bio::Chado::Schema::Result::Phylogeny::PhylonodeRelationship |
|
0.09000 |
metacpan |
Bio::Chado::Schema::Result::Phylogeny::Phylonodeprop |
|
0.09000 |
metacpan |
Bio::Chado::Schema::Result::Phylogeny::Phylotree |
Global anchor for phylogenetic tree. |
0.09000 |
metacpan |
Bio::Chado::Schema::Result::Phylogeny::PhylotreePub |
|
0.09000 |
metacpan |
Bio::Chado::Schema::Result::Project::Project |
|
0.09000 |
metacpan |
Bio::Chado::Schema::Result::Project::ProjectContact |
Linking project(s) to contact(s) |
0.09000 |
metacpan |
Bio::Chado::Schema::Result::Project::ProjectPub |
Linking project(s) to publication(s) |
0.09000 |
metacpan |
Bio::Chado::Schema::Result::Project::ProjectRelationship |
A project can be composed of several smaller scale projects |
0.09000 |
metacpan |
Bio::Chado::Schema::Result::Project::Projectprop |
|
0.09000 |
metacpan |
Bio::Chado::Schema::Result::Pub::Pub |
|
0.09000 |
metacpan |
Bio::Chado::Schema::Result::Pub::PubDbxref |
|
0.09000 |
metacpan |
Bio::Chado::Schema::Result::Pub::PubRelationship |
|
0.09000 |
metacpan |
Bio::Chado::Schema::Result::Pub::Pubauthor |
|
0.09000 |
metacpan |
Bio::Chado::Schema::Result::Pub::Pubprop |
|
0.09000 |
metacpan |
Bio::Chado::Schema::Result::Sequence::Cvtermsynonym |
|
0.09000 |
metacpan |
Bio::Chado::Schema::Result::Sequence::Feature |
|
0.09000 |
metacpan |
Bio::Chado::Schema::Result::Sequence::FeatureCvterm |
|
0.09000 |
metacpan |
Bio::Chado::Schema::Result::Sequence::FeatureCvtermDbxref |
|
0.09000 |
metacpan |
Bio::Chado::Schema::Result::Sequence::FeatureCvtermPub |
|
0.09000 |
metacpan |
Bio::Chado::Schema::Result::Sequence::FeatureCvtermprop |
|
0.09000 |
metacpan |
Bio::Chado::Schema::Result::Sequence::FeatureDbxref |
|
0.09000 |
metacpan |
Bio::Chado::Schema::Result::Sequence::FeaturePub |
|
0.09000 |
metacpan |
Bio::Chado::Schema::Result::Sequence::FeaturePubprop |
Property or attribute of a feature_pub link. |
0.09000 |
metacpan |
Bio::Chado::Schema::Result::Sequence::FeatureRelationship |
|
0.09000 |
metacpan |
Bio::Chado::Schema::Result::Sequence::FeatureRelationshipPub |
|
0.09000 |
metacpan |
Bio::Chado::Schema::Result::Sequence::FeatureRelationshipprop |
|
0.09000 |
metacpan |
Bio::Chado::Schema::Result::Sequence::FeatureRelationshippropPub |
Provenance for feature_relationshipprop. |
0.09000 |
metacpan |
Bio::Chado::Schema::Result::Sequence::FeatureSynonym |
Linking table between feature and synonym. |
0.09000 |
metacpan |
Bio::Chado::Schema::Result::Sequence::Featureloc |
|
0.09000 |
metacpan |
Bio::Chado::Schema::Result::Sequence::FeaturelocPub |
|
0.09000 |
metacpan |
Bio::Chado::Schema::Result::Sequence::Featureprop |
|
0.09000 |
metacpan |
Bio::Chado::Schema::Result::Sequence::FeaturepropPub |
|
0.09000 |
metacpan |
Bio::Chado::Schema::Result::Sequence::IntronCombinedView |
|
0.09000 |
metacpan |
Bio::Chado::Schema::Result::Sequence::IntronlocView |
|
0.09000 |
metacpan |
Bio::Chado::Schema::Result::Sequence::ProteinCodingGene |
|
0.09000 |
metacpan |
Bio::Chado::Schema::Result::Sequence::Synonym |
|
0.09000 |
metacpan |
Bio::Chado::Schema::Result::Sequence::TypeFeatureCount |
per-feature-type feature counts |
0.09000 |
metacpan |
Bio::Chado::Schema::Result::Stock::Stock |
|
0.09000 |
metacpan |
Bio::Chado::Schema::Result::Stock::StockCvterm |
|
0.09000 |
metacpan |
Bio::Chado::Schema::Result::Stock::StockCvtermprop |
|
0.09000 |
metacpan |
Bio::Chado::Schema::Result::Stock::StockDbxref |
|
0.09000 |
metacpan |
Bio::Chado::Schema::Result::Stock::StockDbxrefprop |
|
0.09000 |
metacpan |
Bio::Chado::Schema::Result::Stock::StockGenotype |
|
0.09000 |
metacpan |
Bio::Chado::Schema::Result::Stock::StockPub |
|
0.09000 |
metacpan |
Bio::Chado::Schema::Result::Stock::StockRelationship |
|
0.09000 |
metacpan |
Bio::Chado::Schema::Result::Stock::StockRelationshipCvterm |
|
0.09000 |
metacpan |
Bio::Chado::Schema::Result::Stock::StockRelationshipPub |
|
0.09000 |
metacpan |
Bio::Chado::Schema::Result::Stock::Stockcollection |
|
0.09000 |
metacpan |
Bio::Chado::Schema::Result::Stock::StockcollectionStock |
|
0.09000 |
metacpan |
Bio::Chado::Schema::Result::Stock::Stockcollectionprop |
|
0.09000 |
metacpan |
Bio::Chado::Schema::Result::Stock::Stockprop |
|
0.09000 |
metacpan |
Bio::Chado::Schema::Result::Stock::StockpropPub |
|
0.09000 |
metacpan |
Bio::Chado::Schema::Test |
Library to be used by Bio::Chado::Schema test scripts. |
0.09000 |
metacpan |
Bio::Chado::Schema::Util |
utility functions shared by Bio::Chado::Schema objects |
0.09000 |
metacpan |