Bio-Chado-Schema 0.05801
- Released by
- LETO
- Version
- Release Date
- 2010-07-27
- Kwalitee
- 156.25
- Core Kwalitee
- 100
- LINKS
Bio-Chado-Schema 0.05801 Deleted
Kwalitee Issues
No Core Issues.
- has_meta_json
-
Add a META.json to the distribution. Your buildtool should be able to autogenerate it.
Modules
| Name | Abstract | Version | View |
|---|---|---|---|
| Bio::Chado::Schema | standard DBIx::Class layer for the Chado database schema | 0.05801 | metacpan |
| Bio::Chado::Schema::CellLine::CellLine | metacpan | ||
| Bio::Chado::Schema::CellLine::CellLineCvterm | metacpan | ||
| Bio::Chado::Schema::CellLine::CellLineCvtermprop | metacpan | ||
| Bio::Chado::Schema::CellLine::CellLineDbxref | metacpan | ||
| Bio::Chado::Schema::CellLine::CellLineFeature | metacpan | ||
| Bio::Chado::Schema::CellLine::CellLineLibrary | metacpan | ||
| Bio::Chado::Schema::CellLine::CellLinePub | metacpan | ||
| Bio::Chado::Schema::CellLine::CellLineRelationship | metacpan | ||
| Bio::Chado::Schema::CellLine::CellLineSynonym | metacpan | ||
| Bio::Chado::Schema::CellLine::CellLineprop | metacpan | ||
| Bio::Chado::Schema::CellLine::CellLinepropPub | metacpan | ||
| Bio::Chado::Schema::Companalysis::Analysis | metacpan | ||
| Bio::Chado::Schema::Companalysis::Analysisfeature | metacpan | ||
| Bio::Chado::Schema::Companalysis::Analysisfeatureprop | metacpan | ||
| Bio::Chado::Schema::Companalysis::Analysisprop | metacpan | ||
| Bio::Chado::Schema::Composite::AllFeatureNames | metacpan | ||
| Bio::Chado::Schema::Composite::Dfeatureloc | metacpan | ||
| Bio::Chado::Schema::Composite::FLoc | metacpan | ||
| Bio::Chado::Schema::Composite::FType | metacpan | ||
| Bio::Chado::Schema::Composite::FeatureContains | metacpan | ||
| Bio::Chado::Schema::Composite::FeatureDifference | metacpan | ||
| Bio::Chado::Schema::Composite::FeatureDisjoint | featurelocs do not meet. symmetric | metacpan | |
| Bio::Chado::Schema::Composite::FeatureDistance | metacpan | ||
| Bio::Chado::Schema::Composite::FeatureIntersection | metacpan | ||
| Bio::Chado::Schema::Composite::FeatureMeets | metacpan | ||
| Bio::Chado::Schema::Composite::FeatureMeetsOnSameStrand | metacpan | ||
| Bio::Chado::Schema::Composite::FeatureUnion | metacpan | ||
| Bio::Chado::Schema::Composite::FeaturesetMeets | metacpan | ||
| Bio::Chado::Schema::Composite::FnrType | metacpan | ||
| Bio::Chado::Schema::Composite::FpKey | metacpan | ||
| Bio::Chado::Schema::Composite::Gff3atts | metacpan | ||
| Bio::Chado::Schema::Composite::Gff3view | metacpan | ||
| Bio::Chado::Schema::Composite::Gffatts | metacpan | ||
| Bio::Chado::Schema::Contact::Contact | Model persons, institutes, groups, organizations, etc. | metacpan | |
| Bio::Chado::Schema::Contact::ContactRelationship | Model relationships between contacts | metacpan | |
| Bio::Chado::Schema::Cv::CommonAncestorCvterm | metacpan | ||
| Bio::Chado::Schema::Cv::CommonDescendantCvterm | metacpan | ||
| Bio::Chado::Schema::Cv::Cv | metacpan | ||
| Bio::Chado::Schema::Cv::CvCvtermCount | per-cv terms counts (excludes obsoletes) | metacpan | |
| Bio::Chado::Schema::Cv::CvCvtermCountWithObs | per-cv terms counts (includes obsoletes) | metacpan | |
| Bio::Chado::Schema::Cv::CvLeaf | metacpan | ||
| Bio::Chado::Schema::Cv::CvLinkCount | metacpan | ||
| Bio::Chado::Schema::Cv::CvPathCount | metacpan | ||
| Bio::Chado::Schema::Cv::CvRoot | metacpan | ||
| Bio::Chado::Schema::Cv::Cvterm | metacpan | ||
| Bio::Chado::Schema::Cv::Cvterm::ResultSet | metacpan | ||
| Bio::Chado::Schema::Cv::CvtermDbxref | metacpan | ||
| Bio::Chado::Schema::Cv::CvtermRelationship | metacpan | ||
| Bio::Chado::Schema::Cv::Cvtermpath | metacpan | ||
| Bio::Chado::Schema::Cv::Cvtermprop | metacpan | ||
| Bio::Chado::Schema::Cv::Cvtermsynonym | metacpan | ||
| Bio::Chado::Schema::Cv::Dbxrefprop | metacpan | ||
| Bio::Chado::Schema::Cv::StatsPathsToRoot | metacpan | ||
| Bio::Chado::Schema::Expression::Eimage | metacpan | ||
| Bio::Chado::Schema::Expression::Expression | The expression table is essentially a bridge table. | metacpan | |
| Bio::Chado::Schema::Expression::ExpressionCvterm | metacpan | ||
| Bio::Chado::Schema::Expression::ExpressionCvtermprop | metacpan | ||
| Bio::Chado::Schema::Expression::ExpressionImage | metacpan | ||
| Bio::Chado::Schema::Expression::ExpressionPub | metacpan | ||
| Bio::Chado::Schema::Expression::Expressionprop | metacpan | ||
| Bio::Chado::Schema::Expression::FeatureExpression | metacpan | ||
| Bio::Chado::Schema::Expression::FeatureExpressionprop | metacpan | ||
| Bio::Chado::Schema::General::Db | metacpan | ||
| Bio::Chado::Schema::General::DbDbxrefCount | per-db dbxref counts | metacpan | |
| Bio::Chado::Schema::General::Dbxref | metacpan | ||
| Bio::Chado::Schema::General::Project | metacpan | ||
| Bio::Chado::Schema::General::Tableinfo | metacpan | ||
| Bio::Chado::Schema::Genetic::Environment | The environmental component of a phenotype description. | metacpan | |
| Bio::Chado::Schema::Genetic::EnvironmentCvterm | metacpan | ||
| Bio::Chado::Schema::Genetic::FeatureGenotype | metacpan | ||
| Bio::Chado::Schema::Genetic::Genotype | metacpan | ||
| Bio::Chado::Schema::Genetic::Phendesc | metacpan | ||
| Bio::Chado::Schema::Genetic::PhenotypeComparison | metacpan | ||
| Bio::Chado::Schema::Genetic::PhenotypeComparisonCvterm | metacpan | ||
| Bio::Chado::Schema::Genetic::Phenstatement | metacpan | ||
| Bio::Chado::Schema::Library::Library | metacpan | ||
| Bio::Chado::Schema::Library::LibraryCvterm | metacpan | ||
| Bio::Chado::Schema::Library::LibraryDbxref | metacpan | ||
| Bio::Chado::Schema::Library::LibraryFeature | metacpan | ||
| Bio::Chado::Schema::Library::LibraryPub | metacpan | ||
| Bio::Chado::Schema::Library::LibrarySynonym | metacpan | ||
| Bio::Chado::Schema::Library::Libraryprop | metacpan | ||
| Bio::Chado::Schema::Library::LibrarypropPub | metacpan | ||
| Bio::Chado::Schema::Mage::Acquisition | metacpan | ||
| Bio::Chado::Schema::Mage::AcquisitionRelationship | metacpan | ||
| Bio::Chado::Schema::Mage::Acquisitionprop | Parameters associated with image acquisition. | metacpan | |
| Bio::Chado::Schema::Mage::Arraydesign | metacpan | ||
| Bio::Chado::Schema::Mage::Arraydesignprop | metacpan | ||
| Bio::Chado::Schema::Mage::Assay | metacpan | ||
| Bio::Chado::Schema::Mage::AssayBiomaterial | metacpan | ||
| Bio::Chado::Schema::Mage::AssayProject | Link assays to projects. | metacpan | |
| Bio::Chado::Schema::Mage::Assayprop | Extra assay properties that are not accounted for in assay. | metacpan | |
| Bio::Chado::Schema::Mage::Biomaterial | metacpan | ||
| Bio::Chado::Schema::Mage::BiomaterialDbxref | metacpan | ||
| Bio::Chado::Schema::Mage::BiomaterialRelationship | metacpan | ||
| Bio::Chado::Schema::Mage::BiomaterialTreatment | metacpan | ||
| Bio::Chado::Schema::Mage::Biomaterialprop | metacpan | ||
| Bio::Chado::Schema::Mage::Channel | metacpan | ||
| Bio::Chado::Schema::Mage::Control | metacpan | ||
| Bio::Chado::Schema::Mage::Element | metacpan | ||
| Bio::Chado::Schema::Mage::ElementRelationship | metacpan | ||
| Bio::Chado::Schema::Mage::Elementresult | metacpan | ||
| Bio::Chado::Schema::Mage::ElementresultRelationship | metacpan | ||
| Bio::Chado::Schema::Mage::Magedocumentation | metacpan | ||
| Bio::Chado::Schema::Mage::Mageml | metacpan | ||
| Bio::Chado::Schema::Mage::Protocol | Procedural notes on how data was prepared and processed. | metacpan | |
| Bio::Chado::Schema::Mage::Protocolparam | metacpan | ||
| Bio::Chado::Schema::Mage::Quantification | metacpan | ||
| Bio::Chado::Schema::Mage::QuantificationRelationship | metacpan | ||
| Bio::Chado::Schema::Mage::Quantificationprop | metacpan | ||
| Bio::Chado::Schema::Mage::Study | metacpan | ||
| Bio::Chado::Schema::Mage::StudyAssay | metacpan | ||
| Bio::Chado::Schema::Mage::Studydesign | metacpan | ||
| Bio::Chado::Schema::Mage::Studydesignprop | metacpan | ||
| Bio::Chado::Schema::Mage::Studyfactor | metacpan | ||
| Bio::Chado::Schema::Mage::Studyfactorvalue | metacpan | ||
| Bio::Chado::Schema::Mage::Studyprop | metacpan | ||
| Bio::Chado::Schema::Mage::StudypropFeature | metacpan | ||
| Bio::Chado::Schema::Mage::Treatment | metacpan | ||
| Bio::Chado::Schema::Map::Featuremap | metacpan | ||
| Bio::Chado::Schema::Map::FeaturemapPub | metacpan | ||
| Bio::Chado::Schema::Map::Featurepos | metacpan | ||
| Bio::Chado::Schema::Map::Featurerange | metacpan | ||
| Bio::Chado::Schema::Organism::Organism | metacpan | ||
| Bio::Chado::Schema::Organism::OrganismDbxref | metacpan | ||
| Bio::Chado::Schema::Organism::Organismprop | Tag-value properties - follows standard chado model. | metacpan | |
| Bio::Chado::Schema::Phenotype::FeaturePhenotype | metacpan | ||
| Bio::Chado::Schema::Phenotype::Phenotype | metacpan | ||
| Bio::Chado::Schema::Phenotype::PhenotypeCvterm | metacpan | ||
| Bio::Chado::Schema::Phylogeny::Phylonode | metacpan | ||
| Bio::Chado::Schema::Phylogeny::PhylonodeDbxref | metacpan | ||
| Bio::Chado::Schema::Phylogeny::PhylonodeOrganism | metacpan | ||
| Bio::Chado::Schema::Phylogeny::PhylonodePub | metacpan | ||
| Bio::Chado::Schema::Phylogeny::PhylonodeRelationship | metacpan | ||
| Bio::Chado::Schema::Phylogeny::Phylonodeprop | metacpan | ||
| Bio::Chado::Schema::Phylogeny::Phylotree | Global anchor for phylogenetic tree. | metacpan | |
| Bio::Chado::Schema::Phylogeny::PhylotreePub | metacpan | ||
| Bio::Chado::Schema::Pub::Pub | metacpan | ||
| Bio::Chado::Schema::Pub::PubDbxref | metacpan | ||
| Bio::Chado::Schema::Pub::PubRelationship | metacpan | ||
| Bio::Chado::Schema::Pub::Pubauthor | metacpan | ||
| Bio::Chado::Schema::Pub::Pubprop | metacpan | ||
| Bio::Chado::Schema::Sequence::Cvtermsynonym | metacpan | ||
| Bio::Chado::Schema::Sequence::Feature | metacpan | ||
| Bio::Chado::Schema::Sequence::FeatureCvterm | metacpan | ||
| Bio::Chado::Schema::Sequence::FeatureCvtermDbxref | metacpan | ||
| Bio::Chado::Schema::Sequence::FeatureCvtermPub | metacpan | ||
| Bio::Chado::Schema::Sequence::FeatureCvtermprop | metacpan | ||
| Bio::Chado::Schema::Sequence::FeatureDbxref | metacpan | ||
| Bio::Chado::Schema::Sequence::FeaturePub | metacpan | ||
| Bio::Chado::Schema::Sequence::FeaturePubprop | Property or attribute of a feature_pub link. | metacpan | |
| Bio::Chado::Schema::Sequence::FeatureRelationship | metacpan | ||
| Bio::Chado::Schema::Sequence::FeatureRelationshipPub | metacpan | ||
| Bio::Chado::Schema::Sequence::FeatureRelationshipprop | metacpan | ||
| Bio::Chado::Schema::Sequence::FeatureRelationshippropPub | Provenance for feature_relationshipprop. | metacpan | |
| Bio::Chado::Schema::Sequence::FeatureSynonym | Linking table between feature and synonym. | metacpan | |
| Bio::Chado::Schema::Sequence::Featureloc | metacpan | ||
| Bio::Chado::Schema::Sequence::FeaturelocPub | metacpan | ||
| Bio::Chado::Schema::Sequence::Featureprop | metacpan | ||
| Bio::Chado::Schema::Sequence::FeaturepropPub | metacpan | ||
| Bio::Chado::Schema::Sequence::IntronCombinedView | metacpan | ||
| Bio::Chado::Schema::Sequence::IntronlocView | metacpan | ||
| Bio::Chado::Schema::Sequence::ProteinCodingGene | metacpan | ||
| Bio::Chado::Schema::Sequence::Synonym | metacpan | ||
| Bio::Chado::Schema::Sequence::TypeFeatureCount | per-feature-type feature counts | metacpan | |
| Bio::Chado::Schema::Stock::Stock | metacpan | ||
| Bio::Chado::Schema::Stock::StockCvterm | metacpan | ||
| Bio::Chado::Schema::Stock::StockDbxref | metacpan | ||
| Bio::Chado::Schema::Stock::StockGenotype | metacpan | ||
| Bio::Chado::Schema::Stock::StockPub | metacpan | ||
| Bio::Chado::Schema::Stock::StockRelationship | metacpan | ||
| Bio::Chado::Schema::Stock::StockRelationshipPub | metacpan | ||
| Bio::Chado::Schema::Stock::Stockcollection | metacpan | ||
| Bio::Chado::Schema::Stock::StockcollectionStock | metacpan | ||
| Bio::Chado::Schema::Stock::Stockcollectionprop | metacpan | ||
| Bio::Chado::Schema::Stock::Stockprop | metacpan | ||
| Bio::Chado::Schema::Stock::StockpropPub | metacpan | ||
| Bio::Chado::Schema::Util | utility functions shared by Bio::Chado::Schema objects | metacpan |