Files

• Changes
• LICENSE
• MANIFEST
• META.json
• META.yml
• Makefile.PL
• bin/bp_pairwise_kaks
• dist.ini
• lib/Bio/Tools/Phylo/PAML.pm
• lib/Bio/Tools/Phylo/PAML/Codeml.pm
• lib/Bio/Tools/Phylo/PAML/ModelResult.pm
• lib/Bio/Tools/Phylo/PAML/Result.pm
• lib/Bio/Tools/Run/Phylo/PAML/Baseml.pm
• lib/Bio/Tools/Run/Phylo/PAML/Codeml.pm
• lib/Bio/Tools/Run/Phylo/PAML/Evolver.pm
• lib/Bio/Tools/Run/Phylo/PAML/Yn00.pm
• t/00-compile.t
• t/PAML-parser.t
• t/PAML-run.t
• t/author-eol.t
• t/author-mojibake.t
• t/author-no-tabs.t
• t/author-pod-coverage.t
• t/author-pod-syntax.t
• t/data/M0.mlc
• t/data/aaml.mlc
• t/data/aaml_pairwise.mlc
• t/data/baseml.pairwise
• t/data/baseml.usertree
• t/data/branchSite.mlc
• t/data/bug3331.mlc
• t/data/codeml.mlc
• t/data/codeml315.mlc
• t/data/codeml4.mlc
• t/data/codeml43.mlc
• t/data/codeml43_nssites.mlc
• t/data/codeml45.mlc
• t/data/codeml45b.mlc
• t/data/codeml_lysozyme/2NG.dN
• t/data/codeml_lysozyme/2NG.dS
• t/data/codeml_lysozyme/2NG.tt
• t/data/codeml_lysozyme/4fold.nuc
• t/data/codeml_lysozyme/lnf
• t/data/codeml_lysozyme/lysozymeSmall.ctl
• t/data/codeml_lysozyme/lysozymeSmall.trees
• t/data/codeml_lysozyme/lysozymeSmall.txt
• t/data/codeml_lysozyme/mlc
• t/data/codeml_lysozyme/rst
• t/data/codeml_lysozyme/rst1
• t/data/codeml_lysozyme/rub
• t/data/codeml_nan.mlc
• t/data/codeml_nssites.mlc
• t/data/codeml_parse.mlc
• t/data/cysprot.msf
• t/data/cysprot.raxml.tre
• t/data/gf-s85.phylip
• t/data/singleNSsite.mlc
• t/data/test 2.txt
• t/data/yn00.mlc
• t/data/yn00_45.mlc