Errors

configure_prereq_matches_use

• Module::Build

manifest_matches_dist

• MANIFEST (85) does not match dist (93):
• Missing in MANIFEST: lib/Bio/Phylo/._Adaptor.pm, lib/Bio/Phylo/Matrices/._Datatype.pm, lib/Bio/Phylo/Matrices/._TypeSafeData.pm, lib/Bio/Phylo/Taxa/._TaxaLinker.pm, lib/Bio/Phylo/Taxa/._TaxonLinker.pm, lib/Bio/Phylo/Util/._XMLWritable.pm, t/._regress_21209.t, t/._regress_22813.t

no_dot_underscore_files

• lib/Bio/Phylo/._Adaptor.pm
• lib/Bio/Phylo/Matrices/._Datatype.pm
• lib/Bio/Phylo/Matrices/._TypeSafeData.pm
• lib/Bio/Phylo/Taxa/._TaxaLinker.pm
• lib/Bio/Phylo/Taxa/._TaxonLinker.pm
• lib/Bio/Phylo/Util/._XMLWritable.pm
• t/._regress_21209.t
• t/._regress_22813.t

no_invalid_versions

• lib/Bio/Phylo/Forest.pm: HASH(0x56553913f300)
• lib/Bio/Phylo/Forest/Node.pm: HASH(0x56553901ee80)
• lib/Bio/Phylo/Forest/Tree.pm: HASH(0x5655391cb3e0)
• lib/Bio/Phylo/Generator.pm: HASH(0x5655393547a8)
• lib/Bio/Phylo/IO.pm: HASH(0x565538fcc3d0)
• lib/Bio/Phylo/Listable.pm: HASH(0x565539017190)
• lib/Bio/Phylo/Matrices.pm: HASH(0x565539102500)
• lib/Bio/Phylo/Parsers/Newick.pm: HASH(0x5655391d18e0)
• lib/Bio/Phylo/Parsers/Nexus.pm: HASH(0x565539037fe8)
• lib/Bio/Phylo/Parsers/Table.pm: HASH(0x565539354838)
• lib/Bio/Phylo/Parsers/Taxlist.pm: HASH(0x5655390cacd8)
• lib/Bio/Phylo/Taxa.pm: HASH(0x56553909bf80)
• lib/Bio/Phylo/Taxa/Taxon.pm: HASH(0x56553908a680)
• lib/Bio/Phylo/Treedrawer.pm: HASH(0x5655393549b8)
• lib/Bio/Phylo/Treedrawer/Svg.pm: HASH(0x5655396dba90)
• lib/Bio/Phylo/Unparsers/Mrp.pm: HASH(0x565539010078)
• lib/Bio/Phylo/Unparsers/Newick.pm: HASH(0x565539016e30)
• lib/Bio/Phylo/Unparsers/Nexus.pm: HASH(0x56553908e338)
• lib/Bio/Phylo/Unparsers/Pagel.pm: HASH(0x5655396ebd88)
• lib/Bio/Phylo/Util/CONSTANT.pm: HASH(0x565539098f90)
• lib/Bio/Phylo/Util/Exceptions.pm: HASH(0x565539354ee0)

no_pod_errors

Bio-Phylo-0.16_RC1/lib/Bio/Phylo/Manual.pod -- Around line 132: Non-ASCII character seen before =encoding in 'façade'. Assuming CP1252

use_strict

Bio::Phylo::._Adaptor, Bio::Phylo::Adaptor::Bioperl::Datum, Bio::Phylo::Adaptor::Bioperl::Node, Bio::Phylo::Adaptor::Bioperl::Tree, Bio::Phylo::Matrices::._Datatype, Bio::Phylo::Matrices::._TypeSafeData, Bio::Phylo::Taxa::._TaxaLinker, Bio::Phylo::Taxa::._TaxonLinker, Bio::Phylo::Util::._XMLWritable

use_warnings

Bio::Phylo::._Adaptor, Bio::Phylo::Adaptor, Bio::Phylo::Adaptor::Bioperl::Datum, Bio::Phylo::Adaptor::Bioperl::Matrix, Bio::Phylo::Adaptor::Bioperl::Node, Bio::Phylo::Adaptor::Bioperl::Tree, Bio::Phylo::Forest::Node, Bio::Phylo::Forest::Tree, Bio::Phylo::Generator, Bio::Phylo::IO, Bio::Phylo::Matrices::._Datatype, Bio::Phylo::Matrices::._TypeSafeData, Bio::Phylo::Matrices::Datatype, Bio::Phylo::Matrices::Datatype::Continuous, Bio::Phylo::Matrices::Datatype::Custom, Bio::Phylo::Matrices::Datatype::Dna, Bio::Phylo::Matrices::Datatype::Mixed, Bio::Phylo::Matrices::Datatype::Protein, Bio::Phylo::Matrices::Datatype::Restriction, Bio::Phylo::Matrices::Datatype::Rna, Bio::Phylo::Matrices::Datatype::Standard, Bio::Phylo::Matrices::Datum, Bio::Phylo::Matrices::Matrix, Bio::Phylo::Matrices::TypeSafeData, Bio::Phylo::Parsers::Newick, Bio::Phylo::Parsers::Nexus, Bio::Phylo::Parsers::Table, Bio::Phylo::Parsers::Taxlist, Bio::Phylo::Taxa, Bio::Phylo::Taxa::._TaxaLinker, Bio::Phylo::Taxa::._TaxonLinker, Bio::Phylo::Taxa::TaxaLinker, Bio::Phylo::Taxa::Taxon, Bio::Phylo::Taxa::TaxonLinker, Bio::Phylo::Treedrawer, Bio::Phylo::Treedrawer::Svg, Bio::Phylo::Unparsers::Mrp, Bio::Phylo::Unparsers::Newick, Bio::Phylo::Unparsers::Nexus, Bio::Phylo::Unparsers::Pagel, Bio::Phylo::Util::._XMLWritable, Bio::Phylo::Util::CONSTANT, Bio::Phylo::Util::Exceptions, Bio::Phylo::Util::IDPool, Bio::Phylo::Util::XMLWritable