Bio-Phylo 0.16_RC3
Deleted
Errors
- configure_prereq_matches_use
-
- manifest_matches_dist
-
- MANIFEST (85) does not match dist (87):
- Missing in MANIFEST: t/._regress_21209.t, t/._regress_22813.t
- no_dot_underscore_files
-
- t/._regress_21209.t
- t/._regress_22813.t
- no_invalid_versions
-
- lib/Bio/Phylo/Forest.pm: HASH(0x56553a729e98)
- lib/Bio/Phylo/Forest/Node.pm: HASH(0x56553a719630)
- lib/Bio/Phylo/Forest/Tree.pm: HASH(0x56553a6f1ad0)
- lib/Bio/Phylo/Generator.pm: HASH(0x56553a46c048)
- lib/Bio/Phylo/IO.pm: HASH(0x56553a64a010)
- lib/Bio/Phylo/Listable.pm: HASH(0x56553a643cc8)
- lib/Bio/Phylo/Matrices.pm: HASH(0x56553a506d50)
- lib/Bio/Phylo/Parsers/Newick.pm: HASH(0x56553a6e5540)
- lib/Bio/Phylo/Parsers/Nexus.pm: HASH(0x56553a5e5e30)
- lib/Bio/Phylo/Parsers/Table.pm: HASH(0x56553a5e4388)
- lib/Bio/Phylo/Parsers/Taxlist.pm: HASH(0x56553a4241c0)
- lib/Bio/Phylo/Taxa.pm: HASH(0x56553a6dca78)
- lib/Bio/Phylo/Taxa/Taxon.pm: HASH(0x56553a625268)
- lib/Bio/Phylo/Treedrawer.pm: HASH(0x56553a71e960)
- lib/Bio/Phylo/Treedrawer/Svg.pm: HASH(0x56553a643ae8)
- lib/Bio/Phylo/Unparsers/Mrp.pm: HASH(0x565539c73418)
- lib/Bio/Phylo/Unparsers/Newick.pm: HASH(0x56553a6dd168)
- lib/Bio/Phylo/Unparsers/Nexus.pm: HASH(0x56553a713f18)
- lib/Bio/Phylo/Unparsers/Pagel.pm: HASH(0x56553a6da738)
- lib/Bio/Phylo/Util/CONSTANT.pm: HASH(0x56553a710f58)
- lib/Bio/Phylo/Util/Exceptions.pm: HASH(0x56553a710a90)
- no_pod_errors
-
Bio-Phylo-0.16_RC3/lib/Bio/Phylo/Manual.pod -- Around line 138: Non-ASCII character seen before =encoding in 'façade'. Assuming CP1252
- use_strict
-
Bio::Phylo::Adaptor::Bioperl::Datum, Bio::Phylo::Adaptor::Bioperl::Node, Bio::Phylo::Adaptor::Bioperl::Tree
- use_warnings
-
Bio::Phylo::Adaptor, Bio::Phylo::Adaptor::Bioperl::Datum, Bio::Phylo::Adaptor::Bioperl::Matrix, Bio::Phylo::Adaptor::Bioperl::Node, Bio::Phylo::Adaptor::Bioperl::Tree, Bio::Phylo::Forest::Node, Bio::Phylo::Forest::Tree, Bio::Phylo::Generator, Bio::Phylo::IO, Bio::Phylo::Matrices::Datatype, Bio::Phylo::Matrices::Datatype::Continuous, Bio::Phylo::Matrices::Datatype::Custom, Bio::Phylo::Matrices::Datatype::Dna, Bio::Phylo::Matrices::Datatype::Mixed, Bio::Phylo::Matrices::Datatype::Protein, Bio::Phylo::Matrices::Datatype::Restriction, Bio::Phylo::Matrices::Datatype::Rna, Bio::Phylo::Matrices::Datatype::Standard, Bio::Phylo::Matrices::Datum, Bio::Phylo::Matrices::Matrix, Bio::Phylo::Matrices::TypeSafeData, Bio::Phylo::Parsers::Newick, Bio::Phylo::Parsers::Nexus, Bio::Phylo::Parsers::Table, Bio::Phylo::Parsers::Taxlist, Bio::Phylo::Taxa, Bio::Phylo::Taxa::TaxaLinker, Bio::Phylo::Taxa::Taxon, Bio::Phylo::Taxa::TaxonLinker, Bio::Phylo::Treedrawer, Bio::Phylo::Treedrawer::Svg, Bio::Phylo::Unparsers::Mrp, Bio::Phylo::Unparsers::Newick, Bio::Phylo::Unparsers::Nexus, Bio::Phylo::Unparsers::Pagel, Bio::Phylo::Util::CONSTANT, Bio::Phylo::Util::Exceptions, Bio::Phylo::Util::IDPool, Bio::Phylo::Util::XMLWritable